生物反應器（Bioreactor）是指任何提供生物化學(xué)反應的適當環(huán)境或工程設備。通常是指利用酶(由一個(gè)或一群酵素所推動(dòng))或生物體（如微生物）使裝置具有模擬生物的功能，可在細胞外進(jìn)行生化反應，在模擬的過(guò)程中既可進(jìn)行有氧反應也能進(jìn)行無(wú)氧反應。這些系統在酒類(lèi)、組織工程、生化工程、醫藥生產(chǎn)、有機污染物降解...等應用上是相當重要的一個(gè)裝置。

在來(lái)源上可分為自然生物反應器(如人的胃)及工程生物反應器(如發(fā)酵罐、固定化酶或固定化細胞反應器等，這些生物反應器通常呈圓筒狀，其體積從幾升到幾立方米不等，常由不銹鋼制成)兩種。

依原料加入的方式可分為批次式反應器(Batch reactor)、饋料批次式反應系統(fed batch)以及連續流反應器(Continuous reactor)(如連續攪拌釜式反應器、恒化器)三種。

生物反應器與化學(xué)反應器不盡相同，化學(xué)反應器從原料進(jìn)入到產(chǎn)物的生成過(guò)程中常需要加壓和加熱，屬于一個(gè)高耗能的裝置。而生物反應器則不同，在酶和微生物的參與及常溫常壓下就可以進(jìn)行化學(xué)合成。因此，生物反應器問(wèn)世之后受到化工部門(mén)的重視?；瘜W(xué)工程專(zhuān)家認為，應該盡可能地讓化學(xué)合成的過(guò)程改由生物去完成，因此設計理想的生物反應器，就成了現代生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)的一個(gè)重要任務(wù)。

在生物反應器中生長(cháng)的微生物可以被浸泡在液體介質(zhì)中或附著(zhù)在固體介質(zhì)表面。被浸泡的培樣物質(zhì)可分為懸浮性與固定化：

• 懸浮性生物反應器不需要特別的附著(zhù)表面，因此可使用更多種類(lèi)的生物體，而且可較固定化培養進(jìn)行更大規模的培養操作；但在連續操作過(guò)程中，微生物將從反應器中與流出物一同去除。

• 固定化是一個(gè)通用術(shù)語(yǔ)，描述多種細胞、顆粒附著(zhù)體或包封?；旧纤梢詰糜谒蓄?lèi)型的生物催化，包括酶、胞器、動(dòng)物和植物細胞。其在連續操作的過(guò)程中非常有用，因為生物體不會(huì )與反應器流出物一同除去，但也因此在操作規模上受到限制，因為該微生物是只存在于有限的容器表面上。

大型固定化細胞生物反應器舉例:

• 移動(dòng)床生物反應器(moving media)(MBBR)

• 填充床反應器(packed bed)

• 纖維床生物反應器(fibrous bed)

生物反應器的設計

生物反應器的設計是一個(gè)復雜的生化研究工程科學(xué)任務(wù)。設計的目標是制造最佳的環(huán)境，使微生物或細胞能表現其功能，并產(chǎn)生雜質(zhì)含量符合標準以?xún)鹊漠a(chǎn)物。生物反應器內的溫度、養分濃度、pH值和氣體溶解度(尤其是關(guān)于氧氣的有氧發(fā)酵)等變因皆會(huì )影響生物體的生長(cháng)和生產(chǎn)力。

• 溫度：發(fā)酵培養基的溫度可借由單獨使用冷卻夾套、線(xiàn)圈或同時(shí)使用兩者來(lái)保持；在放熱發(fā)酵反應進(jìn)行時(shí)，需額外使用外部熱交換器。在饋料批次式反應系統(fed-batch system)中，微生物生長(cháng)所需的營(yíng)養物質(zhì)可在培養過(guò)程中連續的加到發(fā)酵罐(fermenter)中，或在發(fā)酵初始時(shí)加入反應器中。

• PH值：利用少量的酸或堿測量和調整培養基的pH值，不同生化反應所需的PH值皆有所不同。

• 氣體溶解度：反應氣體（尤其是氧氣）對于有氧（和少部分厭氧）發(fā)酵而言為必須反應物，但由于氧對于水（幾乎是所有發(fā)酵培養基的基礎）溶解度較低，故其含量對于空氣來(lái)說(shuō)是相對稀少的（20.95％），因此必須連續地添加空氣（或純氧）至反應系統中。在溶液中的上升氣泡可充分混合發(fā)酵培養基，也可同時(shí)“擺脫”溶液中的廢氣，如二氧化碳。一般來(lái)說(shuō)，生物反應器都會(huì )加壓，以增加水中的溶氧量。氧氣的運輸通常是經(jīng)由攪動(dòng)來(lái)完成，也同時(shí)保持營(yíng)養物質(zhì)的均勻分布，幫助勻相發(fā)酵反應進(jìn)行；氣體分散攪拌器(Gas dispersing agitators)就是用來(lái)打破的氣泡使其均勻分布于整個(gè)容器中的工具。

垢會(huì )損害生物反應器的整體效率，尤其是系統中熱量的交換。因此為了避免垢的產(chǎn)生，生物反應器的設計必須易于清理，內表面通常由不銹鋼制成，以便清洗和消毒；典型生物反應器則會(huì )在批次間清洗，或以特殊設計減少連續操作中結垢的可能性。

系統熱傳導的好壞會(huì )間接或直接影響整體反應，因此生物反應器的熱傳導能力是設計的一個(gè)重要部分；小導管可利用冷卻夾套來(lái)冷卻，但較大的導管就可能需要線(xiàn)圈或外部熱交換器。

污水處理(Sewage treatment)

生物反應器也被設計用來(lái)處理污水和廢水。以下舉例三種污水處理法：

• 滴濾池法

為最有效的系統，能提供有流動(dòng)性(free-flowing)且具有化學(xué)惰性(chemically inert)的培養基，讓細菌分解未經(jīng)處理的污水。這些處理過(guò)程通常會(huì )經(jīng)過(guò)一連串獨立、有順序性的大型反應槽、機械分離器(mechanical separator)或旋風(fēng)分離器(cyclone)，以加速水和污泥的分離。其中的曝氣(Aerators)過(guò)程使氧氣溶入污水和培養基中加快污染物的分解?？赏瑫r(shí)處理大量污水，故常被利用于都市廢水處理。

• 活性污泥法

潛水攪拌機(Submersible mixers)在缺氧生物反應器中提供鼓動(dòng)(agitation)，以保持固體顆粒懸浮在溶液中，從而保證細菌和有機物質(zhì)有“相遇”的機會(huì )，并經(jīng)過(guò)分解處理后，使液體的生化需氧量（Biochemical Oxygen Demand, BOD）降低到足以再次被利用。用此方法處理污水的過(guò)程中會(huì )產(chǎn)生大量的固體有機質(zhì)，即生物固形物(biosolids)，其可被收集并做進(jìn)一步處理或干燥后當作肥料。

• 微生物自?xún)舴?/span>

一個(gè)非常簡(jiǎn)單的污水處理生物反應器，指設置一個(gè)化糞池(使污水留在原地)，并加入(或沒(méi)有)介質(zhì)提供適當環(huán)境給細菌；在此系統中，生物污泥(biosludge)本身就是細菌的主要營(yíng)養提供者（activated sludge, 活性污泥），屬于一封閉系統，故不受洪水或水飽和土地(saturated ground)的影響，但處理所需時(shí)間較長(cháng)，因此適合有足夠土地，且不在乎污水處理效率的地區。

微生物為推動(dòng)生物廢水處理的動(dòng)力引擎，密切監測微生物在生物反應器的數量和質(zhì)量是重要的關(guān)鍵?？衫肁TP檢驗(ATP test)來(lái)監測。